Creo que lo que está ocurriendo es que estás dibujando los polígonos en Google Earth con color transparente. De esta manera, cuando conviertes el KML en una capa dentro de ArcGIS usando la herramienta que comentas (KML to Layer) en realidad funciona bien y la capa se crea correctamente, sólo que al ser la línea transparente no ves los contornos de los polígonos. Además, si abres la tabla asociada a tu capa, verás que sí que tiene entidades que son polígonos. Prueba a cambiar el color del contorno de la capa generada en ArcGIS. Verás como tus polígonos sí que están ahí.
Como alternativa, también puedes dibujar los polígonos en Google Earth con un color determinado de contorno, y ese será el que tome por defecto en ArcGIS cuando hagas la conversión. Pero en realidad ni siquiera tienes por qué hacer esto, puesto que la capa que ya convertiste en ArcGIS sólo necesita que le asignes un color de contorno.
CULEBRAS GIS