Una vez hayas elegido cuál será tu punto de referencia cero, la cosa es simple. Extrae la altitud que el DEM da para tu punto de referencia, y ese valor se lo restas a las altitudes de los demás puntos. Lo puedes hacer con la calculadora de campos, directamente sobre la tabla de tus puntos. Eso te dará las nuevas altitudes de tus puntos, pero ya no con respecto al nivel del mar, sino con respecto a tu punto de referencia.
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